Etude de la phage typing

L’étude de la phage typing est une méthode de typage bactérien basée sur la sensibilité d’une souche à un ensemble de bactériophages spécifiques. Chaque phage, ou virus bactérien, infecte sélectivement certaines souches de bactéries, ce qui permet d’obtenir une empreinte unique de sensibilité propre à chaque isolat.

Cette technique est utilisée pour différencier des souches appartenant à une même espèce bactérienne, identifier des contaminations croisées et tracer l’origine de contaminations dans les environnements industriels, agroalimentaires, environnementaux ou pharmaceutiques.

Le phage typing représente un outil de traçabilité microbiologique puissant, notamment pour la surveillance des contaminations persistantes dans les lignes de production, les surfaces industrielles ou les produits finis.

Méthodes et protocoles utilisés

Le phage typing repose sur l’interaction spécifique entre les bactériophages et les bactéries hôtes.

Étapes principales de l’analyse :

1. Culture de la souche bactérienne à typage sur milieu nutritif.
2. Application de différents bactériophages spécifiques sur la surface bactérienne.
3. Observation des plages de lyse (zones claires formées par la destruction bactérienne par le phage).
4. Établissement du profil de sensibilité de la souche à chaque phage testé.
5. Comparaison avec des profils de référence pour identifier ou différencier la souche.

Les méthodes modernes combinent le phage typing classique à des outils moléculaires tels que :

• La PCR pour l’identification génétique des souches ou des phages.
• Le séquençage ADN (NGS) pour une caractérisation fine du génome bactérien et phagique.
• L’analyse bioinformatique pour la classification phylogénétique et la comparaison entre souches isolées.

Matrices concernées

L’étude du phage typing est appliquée à de nombreuses matrices :

• Produits agroalimentaires : lait, viande, produits fermentés, aliments prêts à consommer.
• Surfaces industrielles : chaînes de production, cuves, conditionnements, équipements.
• Eaux et effluents : contrôle microbiologique environnemental.
• Bioproduits et formulations probiotiques : vérification de la pureté et de la stabilité des souches.
• Matériaux et emballages : recherche de contamination bactérienne liée au conditionnement.

Applications industrielles et réglementaires

L’étude de la phage typing est particulièrement utilisée pour :

• Tracer les contaminations croisées au sein d’un site de production.
• Identifier la source d’une contamination récurrente (ex. : Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus, Salmonella enterica).
• Surveiller l’efficacité des protocoles de nettoyage et désinfection.
• Assurer la conformité microbiologique des produits finis.
• Établir un profil de risque bactérien dans le cadre d’un audit qualité ou d’une expertise réglementaire.

Dans le secteur agroalimentaire, cette méthode complète les approches de contrôle microbiologique de surface et d’analyse du microbiote (NGS).

Analyses associées

Pour une approche intégrée de la sécurité microbiologique, YesWeLab recommande de coupler le phage typing à d’autres analyses complémentaires :

• Analyse de l’expression génétique pour relier les profils de sensibilité phagique à l’activité génétique des souches.
• Étude de l’alpha et bêta diversité pour caractériser la composition microbienne globale.
• Test de stérilité pour vérifier l’absence de contamination microbienne dans les produits finis.
• Test écotoxicologique (Microtox) pour évaluer les effets biologiques d’une contamination.

L’expertise YesWeLab

YesWeLab s’appuie sur un réseau de laboratoires accrédités ISO 17025 et COFRAC, spécialisés en microbiologie industrielle et biologie moléculaire.

Grâce à la plateforme digitale YesWeLab, il est possible de :

• Commander et suivre vos analyses en ligne,
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