Estudio de la diversidad alfa y beta

permiteEl análisis de diversidad alfa y beta evaluar la estructura y la variabilidad de la microbiota en una sola muestra o en múltiples muestras.
Mediante la secuenciación de nueva generación (NGS), este método proporciona una visión completa y detallada de la composición microbiana, útil en los campos de la salud, el medio ambiente, la fermentación y la formulación de productos probióticos.

• La diversidad alfa evalúa la riqueza y la uniformidad de las especies presentes en una sola muestra (número de especies observadas, diversidad de Shannon, índice de Simpson, etc.).
• La diversidad beta compara la diferencia en la composición microbiana entre varias muestras (distancias de Bray-Curtis, UniFrac, etc.), lo que permite identificar los factores que influyen en la variabilidad (origen, tratamiento, formulación, entorno...).

Métodos y tecnologías utilizadas

El análisis se basa en la secuenciación de regiones genéticas específicas características de los microorganismos:

• ARNr 16S : para bacterias y arqueas.
• ITS (Internal Transcribed Spacer) : para hongos y levaduras.
• ARNr 18S : para eucariotas unicelulares.

Pasos analíticos:

1. Extracción del ADN total de la muestra.
2. Amplificación por PCR de las regiones objetivo (16S, ITS…).
3. Secuenciación NGS (Illumina MiSeq, NovaSeq, etc.).
4. Procesamiento bioinformático :

• • Filtrado y ensamblaje de secuencias.
  • Atribución taxonómica (de las bases de datos SILVA, Greengenes, UNITE).
  • Cálculo de índices de diversidad alfa y beta.
  • Representación gráfica (mapas de calor, PCA, dendrogramas).

Matrices involucradas

El estudio se aplica a una amplia gama de muestras:

• Suelos y sedimentos : seguimiento de la biodiversidad microbiana, biorremediación.
• Productos fermentados : kéfir, kombucha, yogures, cervezas, vinos, etc.
• Ingredientes probióticos : control de calidad de las cepas y la mezcla microbiana.
• Productos para la salud o nutracéuticos : evaluación de la composición microbiana antes de su comercialización.
• Muestras ambientales : agua, superficies industriales, biopelículas, envases biodegradables.

Aplicaciones industriales y científicas

El estudio de la diversidad alfa y beta nos permite:

• Caracterizar la composición microbiana de una muestra compleja.
• Compara formulaciones, tratamientos o procesos que tengan un impacto en la microbiota.
• Evaluar la estabilidad microbiana de un producto a lo largo del tiempo.
• Controlar la calidad microbiológica de las materias primas, los procesos de fermentación y los productos terminados.
• Optimización de los procesos de fermentación en las industrias alimentaria, nutracéutica o cosmética.
• Medir el impacto ambiental de los materiales o envases sobre la biodiversidad microbiana.

Análisis relacionados

YesWeLab recomienda complementar este estudio con:

• Estudio de la estabilidad microbiológica para monitorizar la evolución de la flora microbiana a lo largo del tiempo.
• Cuantificación de un contaminante en una muestra para evaluar las interacciones entre la microbiota y los contaminantes químicos.

La experiencia de YesWeLab

YesWeLab se apoya en una red de laboratorios especializados en biología molecular y metagenómica, acreditados según las normas ISO 17025 y COFRAC.
Nuestros expertos brindan apoyo a las empresas en:

• La elección de la estrategia de secuenciación apropiada (amplicón, secuenciación aleatoria, ITS, 16S).
• deAnálisis bioinformático y estadístico datos NGS.

Gracias a la plataforma digital YesWeLab, puedes solicitar y realizar un seguimiento de tus análisis en línea, obtener informes interactivos y visualizar tus perfiles microbianos en forma de gráficos y matrices comparativas.