Estudio de la diversidad alfa y beta

El estudio de la diversidad alfa y beta permite analizar la estructura y la variabilidad de la microbiota en una muestra o entre varias.
Mediante secuenciación de ADN de alto rendimiento (NGS – Next Generation Sequencing) , este enfoque proporciona una visión global y detallada de la composición microbiana , útil en los campos de la salud, el medio ambiente, la fermentación y la formulación de productos probióticos.

• La alfa-diversidad evalúa la riqueza y uniformidad de las especies presentes dentro de la misma muestra (número de especies observadas, diversidad de Shannon, índice de Simpson, etc.).
• La beta-diversidad compara la diferencia en la composición microbiana entre varias muestras (distancias de Bray-Curtis, UniFrac, etc.), permitiendo identificar factores que influyen en la variabilidad (origen, tratamiento, formulación, entorno, etc.).

Métodos y tecnologías utilizadas

El análisis se basa en la secuenciación de regiones genéticas diana características de los microorganismos:

• ARNr 16S : para bacterias y arqueas.
• ITS (Internal Transcribed Spacer) : para hongos y levaduras.
• ARNr 18S : para eucariotas unicelulares.

Pasos analíticos:

1. Extracción de ADN total de la muestra.
2. Amplificación por PCR de regiones diana (16S, ITS, etc.).
3. Secuenciación NGS (Illumina MiSeq, NovaSeq, etc.).
4. Procesamiento bioinformático :

• • Filtrado y ensamblaje de secuencias.
  • Atribución taxonómica (de las bases de datos SILVA, Greengenes, UNITE).
  • Cálculo de índices de diversidad alfa y beta.
  • Representación gráfica (mapas de calor, PCA, dendrogramas).

Matrices afectadas

El estudio se aplica a una amplia gama de muestras:

• Suelos y sedimentos : monitoreo de la biodiversidad microbiana, biorremediación.
• Productos fermentados : kéfir, kombucha, yogures, cervezas, vinos, etc.
• Ingredientes probióticos : control de calidad de cepas y mezcla microbiana.
• Productos sanitarios o nutracéuticos : evaluación de la composición microbiana antes de su comercialización.
• Muestras ambientales : agua, superficies industriales, biopelículas, envases biodegradables.

Aplicaciones industriales y científicas

El estudio de la diversidad alfa y beta nos permite:

• Caracterizar la composición microbiana de una muestra compleja.
• Comparar formulaciones, tratamientos o procesos que tienen impacto en la microbiota.
• Evaluar la estabilidad microbiana de un producto a lo largo del tiempo.
• Controlar la calidad microbiológica de materias primas, procesos de fermentación y productos terminados.
• Optimizar los procesos de fermentación en la industria alimentaria, nutracéutica o cosmética.
• Medir el impacto ambiental de los materiales o embalajes sobre la biodiversidad microbiana.

Análisis relacionados

YesWeLab recomienda completar este estudio con:

• Estudio de la estabilidad microbiológica para monitorizar la evolución de la flora microbiana a lo largo del tiempo.
• Medición de un contaminante en una muestra para evaluar las interacciones entre la microbiota y los contaminantes químicos.

Experiencia de YesWeLab

YesWeLab cuenta con una red de laboratorios especializados en biología molecular y metagenómica , acreditados por las normas ISO 17025 y COFRAC .
Nuestros expertos apoyan a las empresas en:

• La elección de la estrategia de secuenciación adecuada (amplicón, escopeta, ITS, 16S).
• Bioinformática y análisis estadístico de datos NGS.

Gracias a la plataforma digital YesWeLab , podrás solicitar y seguir tus análisis online, obtener informes interactivos y visualizar tus perfiles microbianos en forma de gráficos y matrices comparativas.